Olyan kódrendszer, amely kategóriák (fogalmak) jelölésére szolgál. Pl. betegségek, orvosi eljárások, foglalkozások, stb. kóddal történő leírása.
Két alapvető típust szokás megkülönböztetni, aszerint, hogy a kódokkal jelölt fogalmi rendszer milyen célra készült.
Az egyik típust klasszifikációs rendszernek nevezzük. Erre az jellemző, hogy a fogalmi egységek aránylag tág kategóriák, nem túl részletezőek. Az ilyen rendszerek statisztikák készítésére szolgálnak, és éppen azért tartalmaznak tágabb kategóriákat, hogy minden kategóriában biztosítható legyen a statisztikai vizsgálathoz nélkülözhetetlen mintanagyság (megfelelő esetszám). Az orvosi klasszifikációs kódrendszerek ennek megfelelően nem egyes személyek, hanem egy populáció állapotának jellemzésére szolgálnak. Az első orvosi klasszifikációk jóval a számítógépek megjelenése, elterjedése előtt keletkeztek.
A másik csoportba az úgynevezett nomenklatúrák tartoznak, ahol a cél a részlet-információk minél tökéletesebb ábrázolhatósága. Az ide tartozó orvosi kódrendszerek kifejezetten az egyes betegek adatainak gépi ábrázolására készültek.